Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITSN1Q15811 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms