Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms