Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIX1Q15475 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIX1Q15475 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms