Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GAPVD1Q14C86 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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