Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM53BQ14153 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms