Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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