Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CDH18Q13634 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDH18Q13634 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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