Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAD4Q13485 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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