Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP3B2Q13367 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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