Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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