Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKAA1Q13131 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PRKAA1Q13131 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PRKAA1Q13131 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRKAA1Q13131 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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