Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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