Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms