Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms