Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA3Q08378 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms