Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms