Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms