Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREMQ03060 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREMQ03060 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms