Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NDPQ00604 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NDPQ00604 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms