Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COG7P83436 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COG7P83436 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COG7P83436 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COG7P83436 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COG7P83436 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COG7P83436 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG7P83436 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms