Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms