Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSE1LP55060 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms