Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2A2P52657 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms