Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNQ1P51787 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms