Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPD2P43304 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms