Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCAMP43121 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCAMP43121 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCAMP43121 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms