Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAEP38570 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms