Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms