Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms