Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GTF2E2P29084 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms