Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms