Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELFEP18615 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELFEP18615 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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