Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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