Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms