Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DESP17661 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DESP17661 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms