Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LAMC1P11047 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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