Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

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Length 1,927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LCTP09848 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LCTP09848 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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LCTP09848 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LCTP09848 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LCTP09848 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LCTP09848 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LCTP09848 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LCTP09848 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LCTP09848 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LCTP09848 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LCTP09848 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCTP09848 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCTP09848 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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