Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
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