Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSL4O60488 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms