Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRTO14522 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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