Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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