Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP15Q9Y4E8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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