Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms