Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD5Q9P267 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms