Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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GCNT4Q9P109 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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