Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms