Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms