Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms