Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms