Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRACR2AQ9BSW2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms